58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3545 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  36.23 
 
 		 226 aa  101  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  37.02 
 
 		 184 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  36.59 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  32.75 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  32.09 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  29.9 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  31.72 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  27.42 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  29.41 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  30.73 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  31.55 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  31.05 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  31.52 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  29.78 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  30.6 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  31.72 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  30.39 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  32.77 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  29.83 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  31.87 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  29.06 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  29.06 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  28.22 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  30.22 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  31.91 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  30.68 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  28.25 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  28.25 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  28.25 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  28.5 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  30.21 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  32.74 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  32.12 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  32.56 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  28.42 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  30.18 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  29.28 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  27.51 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  32.06 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  28.73 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  25.67 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  29.52 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.49 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  27.23 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  28.02 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  26.4 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  26.23 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  26.55 
 
 		 187 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  26.74 
 
 		 272 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  28.31 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  28.98 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>