47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0200 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  32.31 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  32.63 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  32.28 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  32.29 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  31.91 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  32.16 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  30.34 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  32.22 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  30.93 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  28.12 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  27.61 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  31.77 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  29.57 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  28.02 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  27.57 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  32.79 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  32.66 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  26.56 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  33.15 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  29.57 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  27.13 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  29.61 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  31.11 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  28.14 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  28.96 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4225  hypothetical protein  36.36 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  27.78 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  27.78 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  25.56 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  25.86 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  26.18 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  29.27 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  28.38 
 
 		 258 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  27.66 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  26.32 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  26.97 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  28.14 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  30.22 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  29.5 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  42.86 
 
 		 224 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  26.06 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  26.2 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  20.88 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>