22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2290 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  53.44 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  53.97 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  52.91 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  34.48 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  32.26 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  30.38 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  32.66 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  30.73 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  32.43 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  28.8 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  33.14 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  30.65 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  32.11 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  29.11 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  26.46 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  33.61 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  28.65 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  28.89 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  28.89 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  32.35 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>