55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2112 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  346  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  51.12 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  42.37 
 
 		 202 aa  134  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  43.18 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  39.88 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  44.38 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  40.8 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  36.05 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  32.58 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  32.94 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  31.18 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  30.88 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  32.22 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  33.52 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  31.21 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  31.21 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  31.21 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  31.48 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  32.14 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  34.66 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  32.58 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  32.14 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  32.3 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  30.86 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  28.65 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  28.83 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 437 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  30.28 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  44.93 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  28.49 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  30.06 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  28.42 
 
 		 197 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  29.82 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  27.49 
 
 		 188 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  33.12 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  30.94 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  28.89 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  26.88 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  32.34 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  25.54 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  27.44 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  30.63 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  27.62 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  31.76 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  28.47 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  32.57 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  29.6 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  31.31 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  31 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  31 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  26.37 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  26.02 
 
 		 202 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>