34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4530 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  363  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  43.58 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  42.54 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  42.95 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  38.55 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  91.3  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  33.77 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  33.16 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  34.76 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  30.41 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  33.51 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  30.26 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  29.84 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  32.28 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  31.18 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  30.56 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  28.87 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  28.88 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  30.27 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  29.1 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  29.79 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  27.47 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  30.97 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  27.69 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  28.02 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  27.46 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  26.67 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  26.29 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  37.21 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  28.89 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  25.81 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  29.17 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  25.93 
 
 		 224 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>