35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0105 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  54.59 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  51.34 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  53.97 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  42.54 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  38.92 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  33.7 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  32.22 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  29.8 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  29.38 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  31.28 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  33.06 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  29.79 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  34.66 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  28.18 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  32.28 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  32.79 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  31.65 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  34.81 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  30.41 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  26.95 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  27.27 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  55.81 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  55.81 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  26.11 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  28.65 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  48.84 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  26.74 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  28.75 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  26.99 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  46.88 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  36.21 
 
 		 272 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  25.28 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>