36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1377 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  50.27 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  48.02 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  37.5 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  36.42 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  35.68 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  32.97 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  32.97 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  31.67 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  33.52 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  38.75 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  33.91 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  31.61 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  27.92 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  28.82 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  30.64 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  26.02 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  37.93 
 
 		 131 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  40.62 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  31.94 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  31.85 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  29.55 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  28.22 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  39.44 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  39.71 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  39.44 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  39.44 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  27.32 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  34.67 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  22.61 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  28 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  36.62 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  34.29 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  26.79 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  32.47 
 
 		 197 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1510  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  30.91 
 
 		 273 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0743191  decreased coverage  0.0006331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>