25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2969 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  370  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  51.34 
 
 
187 aa  174  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  52.91 
 
 
190 aa  160  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  43.72 
 
 
188 aa  154  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  42.95 
 
 
183 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  39.22 
 
 
184 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  36.42 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  29.35 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  30.68 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  30.28 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  31.03 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  31.79 
 
 
206 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  26.75 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  31.79 
 
 
206 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  27.37 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  27.38 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  25.62 
 
 
184 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  27.62 
 
 
177 aa  44.7  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  27.03 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  27.6 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3849  hypothetical protein  30.53 
 
 
263 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  26.4 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3508  hypothetical protein  46.81 
 
 
237 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202242  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  40.85 
 
 
220 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  31.11 
 
 
196 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>