57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1843 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  51.12 
 
 
177 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  39.36 
 
 
202 aa  140  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  39.34 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  39.88 
 
 
196 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  41.05 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  31.72 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  39.02 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  33.86 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  36.42 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  31.64 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  28.65 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  29.84 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  30.11 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  32.11 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  32.4 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  29.94 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  33.13 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  29.78 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  29.78 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  29.78 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  29.89 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  26.54 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  27.23 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  31.85 
 
 
194 aa  58.2  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  32.12 
 
 
191 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  32.19 
 
 
186 aa  58.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  30.53 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  30.06 
 
 
188 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  30.34 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  26.62 
 
 
198 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  30.23 
 
 
187 aa  54.7  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  30.2 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  29.01 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  27.54 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  32.34 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  28.42 
 
 
193 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  31.79 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  26.7 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  28.87 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  32.89 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
437 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  28.82 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  26.67 
 
 
200 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  27.08 
 
 
193 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  29.19 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  30.34 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  26.84 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  26.84 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  30.65 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  27.84 
 
 
197 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  26.74 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  28.18 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  28.72 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  26.17 
 
 
230 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  28.57 
 
 
203 aa  41.2  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>