44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5062 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  99.4 
 
 
189 aa  335  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  97.6 
 
 
194 aa  332  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  58.43 
 
 
190 aa  191  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  55.15 
 
 
190 aa  186  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  51.79 
 
 
191 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  49.09 
 
 
196 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  49.1 
 
 
197 aa  141  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  48.54 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  49.39 
 
 
194 aa  134  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  41.18 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  36.75 
 
 
191 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  37.8 
 
 
180 aa  95.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  37.28 
 
 
207 aa  94.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  34.76 
 
 
185 aa  92  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  31.07 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  32.3 
 
 
189 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  26.86 
 
 
192 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  29.63 
 
 
184 aa  53.9  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  31.48 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  31.3 
 
 
131 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  30.77 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  29.27 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  39.44 
 
 
194 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  28.66 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  32.18 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  36.25 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  27.18 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  31.03 
 
 
206 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  31.03 
 
 
206 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  27.61 
 
 
194 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  27.61 
 
 
194 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  27.61 
 
 
194 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  24.85 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.32 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
437 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  31 
 
 
177 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  26.37 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  38.36 
 
 
200 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  23.64 
 
 
194 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  34.85 
 
 
194 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  30.81 
 
 
230 aa  41.2  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  40.8  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>