30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4246 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  44.38 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  38.92 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  41.05 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  35.03 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  32.63 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  31.77 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  30.2 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  29.74 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  32.1 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  34.71 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  30.46 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  28.65 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  41.79 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  27.46 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  28.87 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  25.54 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  26.42 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  46.27 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  29.01 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  31.63 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  26.67 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  34.75 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  35.48 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  36.08 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  31.03 
 
 		 249 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  32.5 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  34.85 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>