45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13807 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  56.52 
 
 
194 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  56.52 
 
 
194 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  56.52 
 
 
194 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  47.4 
 
 
437 aa  161  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  29.78 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  30.53 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  30.49 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  25.67 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  32.1 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  31.48 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  28.81 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  27.59 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  25.68 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  26.67 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  28.42 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  28.02 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  30.39 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  26.47 
 
 
193 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  29.12 
 
 
184 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  25.14 
 
 
194 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  29.47 
 
 
200 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  25.27 
 
 
198 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  26.28 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  27.39 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  26.75 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  26.9 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  29.12 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  32 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  28.95 
 
 
197 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  28.44 
 
 
197 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  29.53 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  24.02 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  30.58 
 
 
131 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  32.63 
 
 
238 aa  44.7  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  27.27 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  38.03 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  23.96 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  25.81 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  24.24 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  27.06 
 
 
188 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  23.64 
 
 
167 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  23.64 
 
 
189 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  25.28 
 
 
187 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>