39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0874 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  393  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  36.55 
 
 
226 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  32.09 
 
 
197 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  34.38 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  30.39 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  32.91 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  31.51 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  30.56 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  34.11 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  29.44 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  28.98 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  28.57 
 
 
230 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  30.13 
 
 
182 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  28.95 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  31.76 
 
 
185 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  29.27 
 
 
167 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  29.67 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  30.83 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  31.98 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  31.98 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  31.98 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  29.57 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  29.41 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  30.56 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  28.37 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  37.23 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  30.83 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  29.93 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  25 
 
 
196 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  32.03 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  26.9 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  28.71 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  31.78 
 
 
189 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  28.71 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  28.89 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  28.26 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  29.82 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  29.41 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  27.96 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>