46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1069 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  377  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  51.06 
 
 
194 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  51.06 
 
 
189 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  47.87 
 
 
190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  46.03 
 
 
196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  51.83 
 
 
194 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  51.79 
 
 
167 aa  160  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  47.25 
 
 
197 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  43.3 
 
 
194 aa  158  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  43.92 
 
 
190 aa  147  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  43.33 
 
 
186 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  37.57 
 
 
185 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  37.04 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  36.27 
 
 
180 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  37.06 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  31.72 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  33.68 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  32.61 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  31.16 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  31.16 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  30.39 
 
 
194 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  30.65 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  30.68 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  27.36 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  29.53 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  30.99 
 
 
184 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  28.72 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  27.07 
 
 
192 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
437 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  28.18 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  28.18 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  31.9 
 
 
131 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  27.69 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  31.76 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  28.18 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  28.88 
 
 
184 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  26.55 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  26.53 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  31.46 
 
 
238 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  29.65 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  27.87 
 
 
186 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  32.34 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  28.16 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  24.16 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  24.35 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  26.77 
 
 
202 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>