55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2519 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  370  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  35.33 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  32.11 
 
 
198 aa  82  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  32.45 
 
 
206 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  31.38 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  31.38 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  31.4 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  30.73 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  31.34 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  29.69 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  31.32 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  32.7 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  32.14 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  32.11 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  29.14 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  29.31 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  29.31 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  29.31 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  31.3 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  29.61 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  28.96 
 
 
230 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  29.12 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  31.14 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  28.8 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  25.68 
 
 
194 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  28.14 
 
 
187 aa  55.1  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  28.06 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  29.57 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  31.82 
 
 
200 aa  51.6  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  29.55 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  31.65 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.14 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  26.52 
 
 
188 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  30.57 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  27.81 
 
 
226 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  28.14 
 
 
196 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  28.42 
 
 
187 aa  47.8  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  27.82 
 
 
194 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  30.99 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  33.06 
 
 
198 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  27.37 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
437 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  26.74 
 
 
194 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1558  hypothetical protein  26.6 
 
 
200 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  27.01 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  28.04 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  28.47 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  30.53 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3849  hypothetical protein  27.7 
 
 
263 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  27.82 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  29.17 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  28.73 
 
 
188 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  41.2  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  24.87 
 
 
190 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>