44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1118 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  370  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  73.54 
 
 
190 aa  278  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  57.98 
 
 
194 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  57.45 
 
 
189 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  58.43 
 
 
167 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  46.32 
 
 
196 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  47.87 
 
 
191 aa  155  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  46.51 
 
 
197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  43.23 
 
 
194 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  45.45 
 
 
194 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  39.04 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  36.76 
 
 
180 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  32.64 
 
 
185 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  35.75 
 
 
207 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  35.5 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  31.15 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  29.95 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  29.26 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  31.15 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  30.36 
 
 
131 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  27.81 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  32.56 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  32.56 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  32.56 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  30.06 
 
 
177 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  29.27 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  28.87 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  31.28 
 
 
230 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  29.5 
 
 
198 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
437 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  30.3 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  29.53 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  29.44 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  25.39 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  25.39 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  25.39 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  29.31 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  27.78 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  32.86 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  39.13 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  27.84 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  32.14 
 
 
193 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.74 
 
 
196 aa  41.6  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  24.87 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>