49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2309 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  378  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  31.75 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  32.63 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  30.37 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  32.22 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  31.35 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  30.69 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  32.58 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  30.26 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  30.73 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  31.97 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  29.56 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  26.9 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  28.93 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.01 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  39.74 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  28.42 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  25.14 
 
 		 157 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  27.89 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  30.98 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  28.04 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  23.43 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  26.02 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  28.19 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  35.71 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  26.09 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  41.18 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  24.87 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  27.38 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  36.25 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  36.25 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  27.03 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1478  hypothetical protein  31.51 
 
 		 309 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  28.89 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1475  hypothetical protein  31.51 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5026  hypothetical protein  30.63 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1122  hypothetical protein  29.32 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1500  hypothetical protein  31.51 
 
 		 309 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  32.86 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  37.18 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  26.35 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  24.86 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  25.84 
 
 		 196 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  26.06 
 
 		 187 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  26.17 
 
 		 194 aa  42  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  38.16 
 
 		 220 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  27.22 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>