58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0059 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  393  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  32.81 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  77.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  30.81 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1558  hypothetical protein  31.53 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  29.44 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  29.85 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  28.5 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  28.5 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  30.05 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  30.27 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  25.67 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  28.96 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  29.94 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  31.21 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  28 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  26.63 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  26.63 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  26.98 
 
 
185 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  28.88 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  24.87 
 
 
202 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  26.86 
 
 
167 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  23.24 
 
 
180 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  27.55 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  26.9 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  28.49 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  28.14 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  27.81 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  25.84 
 
 
197 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  30.47 
 
 
216 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  27.57 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  24.1 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  27.07 
 
 
191 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  26.2 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  26.2 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  26.2 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  26.19 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  24.06 
 
 
189 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  27.53 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  24.86 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2918  hypothetical protein  40.74 
 
 
233 aa  44.7  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1478  hypothetical protein  26.83 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1500  hypothetical protein  26.83 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  21.67 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6379  hypothetical protein  22.73 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  27.47 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  27.49 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  23.45 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  26.06 
 
 
226 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  28.35 
 
 
197 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5617  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  40.91 
 
 
256 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  normal  0.170718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  27.04 
 
 
200 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  25.41 
 
 
220 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  24.75 
 
 
220 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1475  hypothetical protein  25.2 
 
 
259 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  31.5 
 
 
249 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  31.5 
 
 
249 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  26.32 
 
 
189 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>