40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5694 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  374  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  73.54 
 
 
190 aa  278  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  56.15 
 
 
194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  55.61 
 
 
189 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  55.15 
 
 
167 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  46.49 
 
 
197 aa  157  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  46.84 
 
 
196 aa  150  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  43.92 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  39.9 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  43.85 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  38.17 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  34.07 
 
 
185 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  36.41 
 
 
180 aa  104  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  38.55 
 
 
186 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  37.5 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  30.35 
 
 
226 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  31.15 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  31.91 
 
 
194 aa  58.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  29.17 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  29.17 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  32.39 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  28.65 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  30.64 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  30.64 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  30.64 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  30.05 
 
 
202 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  30.46 
 
 
200 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  30.85 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  32.26 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  28.73 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  35.71 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  32.03 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  30.63 
 
 
177 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  28 
 
 
437 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  31.65 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  26.95 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  24.76 
 
 
220 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  34.29 
 
 
194 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  28.98 
 
 
197 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>