52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2150 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  406  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  406  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  97.09 
 
 
206 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  52.68 
 
 
230 aa  182  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  49.26 
 
 
202 aa  175  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1558  hypothetical protein  56.63 
 
 
200 aa  174  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  53.06 
 
 
193 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  32.45 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  33.56 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  33.5 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  28.5 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  31.16 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  31.52 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  31.25 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  31.1 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  29.29 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  32.54 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  28.65 
 
 
180 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  29.74 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  29.41 
 
 
197 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  29.47 
 
 
184 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  30.21 
 
 
194 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  32.37 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  28.81 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  29.21 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  26.98 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  30.06 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  26.13 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  27.13 
 
 
188 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  31.09 
 
 
194 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  30 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  29.31 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  26.94 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  25.52 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  28.28 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  35.4 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  25.38 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  31.03 
 
 
167 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  25.91 
 
 
194 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  29.19 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  27.75 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  29.05 
 
 
187 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  27.45 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  24.31 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  29.45 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  24.31 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  24.31 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  35.38 
 
 
188 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  27.22 
 
 
198 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  26.37 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  25.51 
 
 
189 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>