43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7305 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  62.7 
 
 
202 aa  233  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  43.18 
 
 
177 aa  134  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  39.34 
 
 
186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  40 
 
 
194 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  31.37 
 
 
196 aa  85.5  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  31.94 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  33.16 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  29.41 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  32.29 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  30.37 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  35.97 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  31.82 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  34.78 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  33.7 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  32.95 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  29.84 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  29.9 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  33.51 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  31.25 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  30.39 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  33.08 
 
 
226 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  29.06 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  27.91 
 
 
189 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  30.51 
 
 
187 aa  54.7  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  28.26 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  29.52 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  30.64 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  32.95 
 
 
184 aa  51.6  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  38.38 
 
 
131 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  27.93 
 
 
188 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  24.06 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  28.12 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  29.27 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  26.18 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  25.77 
 
 
187 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2418  hypothetical protein  32.53 
 
 
221 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000255107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  28.35 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  32.11 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  25.65 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  28.12 
 
 
208 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>