33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3542 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  317  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  37.82 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  28.29 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  29.44 
 
 		 202 aa  77  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  32.31 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  32.4 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  29.89 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  28.41 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  26.37 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  30.94 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  28.65 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  27.39 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  26.23 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  30.9 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  29.28 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  28.16 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  29.94 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  31.28 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  25.99 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  33.58 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  27.75 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  25.6 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  27.37 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  35.71 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  28.9 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  27.43 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  27.59 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  23.5 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  40.62 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  22.63 
 
 		 192 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  45.71 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  45.71 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  45.71 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>