35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1384 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  37.02 
 
 
197 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  30.53 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  34.92 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  30.64 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  29.95 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  26.4 
 
 
180 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  31.84 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  29.95 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  29.57 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  29.95 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  29.95 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  31.45 
 
 
226 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  29.12 
 
 
194 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  27.87 
 
 
188 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  31.79 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  26.06 
 
 
207 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  28.33 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  26.53 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  30.48 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  31.18 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  27.13 
 
 
196 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  29.78 
 
 
194 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  29.12 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  29.07 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  28.88 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  28.18 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  28.18 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  27.59 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  27.03 
 
 
193 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  26.92 
 
 
182 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  33.88 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  29.68 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  29.5 
 
 
198 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
437 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>