43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3933 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  378  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  36.32 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  34.47 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  36.22 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  33.87 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  29.89 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  34.92 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  35.19 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  33.16 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  30.41 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  30.16 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  31.95 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  29.51 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  30.16 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  30.16 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  31.9 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  34.39 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  29.89 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  30.61 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 437 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  28.93 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  39.71 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  32.92 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  27.68 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  29.48 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  30.52 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  28.74 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  30.83 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  32.37 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  31.93 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  31.74 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  26.52 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  31.1 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  29.09 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  28.65 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  29.76 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  29.48 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  25.99 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  32.5 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  26.9 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  27.32 
 
 		 193 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>