43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0915 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  46.49 
 
 
190 aa  157  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  50.84 
 
 
194 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  50.57 
 
 
189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  47.25 
 
 
191 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  46.51 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  49.1 
 
 
167 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  41.4 
 
 
196 aa  128  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  41.95 
 
 
194 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  40.1 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  35.26 
 
 
186 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  35.96 
 
 
207 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  33.52 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  29.67 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  32.94 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  32.31 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  32.31 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  28.1 
 
 
220 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  24.44 
 
 
196 aa  57.8  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  30.64 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  27.57 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  25.84 
 
 
192 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  28.12 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.01 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  25.29 
 
 
184 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  26.15 
 
 
189 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  28.44 
 
 
194 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  31.17 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  26.8 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4528  hypothetical protein  45.65 
 
 
282 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  29.55 
 
 
238 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  30.11 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  27.84 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  27.45 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  27.45 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  26.32 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  23.73 
 
 
202 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  25.41 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  32.47 
 
 
194 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>