57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4394 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  47.73 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  42.26 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  44.44 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  39.04 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  41.34 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  41.44 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  43.33 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  40.46 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  41.18 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  45.26 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  35.26 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  38.55 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  35.98 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  38.6 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  36.46 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  36.13 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  34.38 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  32.75 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  31.21 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  30.43 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  32.39 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  34.66 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  32.4 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  30.98 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  30.98 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  34.86 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  34.78 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  28.65 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  27.87 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  27.6 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  32.1 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  31.67 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  34.51 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  30.86 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  28.87 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  30.34 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  31.84 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  28.14 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  29.41 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  39.74 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  30.69 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  26.97 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  28.05 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  35.96 
 
 		 202 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  29.78 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  28.44 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  28.99 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  46.27 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  29.05 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  27.01 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  30.22 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>