26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6375 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  59.92 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  28.1 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  27.83 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  27.83 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  27.83 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  30.2 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  29.3 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  25.94 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  28.84 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  29.69 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  29.67 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  27.86 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  27.98 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  28.44 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  27.23 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  27.18 
 
 		 167 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  23.61 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  25.5 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  28.88 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  38.03 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  25.74 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  24.76 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  40.85 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  24.75 
 
 		 192 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>