53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7213 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  360  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  41.08 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  44.44 
 
 		 186 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  40.32 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  38.83 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  38.83 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  36.76 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  43.11 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  39.79 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  36.41 
 
 		 190 aa  104  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  35.57 
 
 		 194 aa  97.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  36.51 
 
 		 191 aa  97.4  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  37.8 
 
 		 167 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  33.52 
 
 		 197 aa  93.6  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  35.39 
 
 		 196 aa  88.2  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  33.95 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  33.95 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  33.95 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  30.19 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  34.95 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  33.86 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  32.58 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  29.38 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  30.88 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  29.83 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  32.74 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  28.27 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  32.04 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  32.42 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  29.12 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  28.14 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  27.55 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  27.55 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  27.49 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  26.4 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  23.24 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  30.94 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  26.29 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  27.92 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  30.3 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  29.69 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  26.7 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  27.39 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 437 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  28.89 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  33.05 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  36.62 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  28.98 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  27.92 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>