43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04730 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  100 
 
 		 196 aa  391  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  39.88 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  39.88 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  31.37 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  30.56 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  35.03 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  32.28 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  28 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  30.72 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  24.59 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  24.44 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  27.57 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  29.19 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  27.17 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  27.69 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  33.06 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  26.14 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  30.51 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  26.26 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  30.06 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  30.06 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  30.33 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  26.23 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  37.31 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  26.38 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  29.03 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  30.47 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  26.6 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  31.25 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  25.77 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  29.11 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  27.01 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  29.05 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  25.73 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  30.3 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  28.33 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  27.87 
 
 		 220 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  25.84 
 
 		 193 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3508  hypothetical protein  32.2 
 
 		 237 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  31.93 
 
 		 131 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  26.74 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  24.35 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>