51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3609 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  437  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  51.66 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  47.24 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  44.12 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  40.21 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  40.21 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  40.21 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  40.39 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  38.46 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  39.13 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  36.19 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  32.06 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  34.88 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  31.63 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  35.47 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  33.97 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  34.29 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  34.09 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  31.43 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  33.8 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  31.03 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  32.42 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  33.48 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  33.48 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  34.11 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  32.28 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  31.6 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  35.53 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  29.76 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  31.28 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  32.09 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  31.66 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  28.27 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  40.4 
 
 		 173 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  27.61 
 
 		 192 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  33.59 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  37.21 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1475  hypothetical protein  25.29 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  42.86 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  26.15 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  29.69 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1122  hypothetical protein  27.27 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3655  hypothetical protein  27.19 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0168589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3508  hypothetical protein  30.34 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  31.31 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  27.87 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4225  hypothetical protein  34.69 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1500  hypothetical protein  25.97 
 
 		 309 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1478  hypothetical protein  25.97 
 
 		 309 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  34.2 
 
 		 272 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>