39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0923 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  50.47 
 
 
220 aa  205  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  50.99 
 
 
215 aa  175  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  45.69 
 
 
208 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  38.57 
 
 
229 aa  158  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  41.29 
 
 
211 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  38.54 
 
 
215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  36.27 
 
 
213 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  36.32 
 
 
227 aa  122  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  35.29 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  34.39 
 
 
224 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  31.4 
 
 
209 aa  98.2  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  39.35 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  32.98 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  34.5 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  34.5 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  34.5 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  29.82 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  29.95 
 
 
205 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  31.25 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  31.22 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  30.2 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  30.88 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  32.84 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  28.22 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  29.21 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  29.21 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  27.6 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  29.7 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  28.78 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  28.04 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  28.95 
 
 
199 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  28.12 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  30.65 
 
 
306 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  48.78 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  25.83 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  26.07 
 
 
264 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3218  hypothetical protein  38.33 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000118719  hitchhiker  0.000448278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>