40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0559 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  68.46 
 
 		 306 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  63.74 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  53.82 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  50.78 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  46.85 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  46.4 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  43.19 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  43.19 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  43.19 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  44.27 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  42.8 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  43.6 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  45.45 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  43.77 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  42.38 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  42.4 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  41.44 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  41.44 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  41.44 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  44.98 
 
 		 261 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  45.21 
 
 		 261 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  42.21 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  42.8 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  37.25 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  38.91 
 
 		 270 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  40 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  37.29 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  34.29 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  31.89 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  31.02 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  30.5 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  34.34 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  26.97 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  28.83 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  28.32 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  29.17 
 
 		 173 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  26.13 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  29.05 
 
 		 194 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>