34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4556 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  522  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  59.77 
 
 		 269 aa  288  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  57.03 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  54.96 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  54.96 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  54.96 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  55.68 
 
 		 269 aa  258  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  55.81 
 
 		 264 aa  258  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  55.34 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  55.86 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  51.53 
 
 		 271 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  48.09 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  55.36 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  54.72 
 
 		 261 aa  222  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  45.42 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  47.13 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  47.13 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  47.13 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  52.42 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  47.91 
 
 		 270 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  49.81 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  53.64 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  45.14 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  49.23 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  46.09 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  47.21 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  42.69 
 
 		 250 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  42.8 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  42.75 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  42.64 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  31.66 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  30.77 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  38.34 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  30.86 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>