36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3832 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  100 
 
 		 269 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  63.75 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  59.85 
 
 		 264 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  59.14 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  59.14 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  59.14 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  58.37 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  58.37 
 
 		 260 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  55.26 
 
 		 271 aa  270  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  59.84 
 
 		 261 aa  258  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  55.68 
 
 		 266 aa  255  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  54.55 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  60.16 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  52.63 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  53.52 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  49.81 
 
 		 270 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  46.69 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  50.2 
 
 		 332 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  53.31 
 
 		 269 aa  221  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  46.51 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  45.74 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  45.74 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  45.74 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  44.62 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  43.97 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  46.4 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  41.98 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  42.35 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  38.26 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  40 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  34.94 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  32.82 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  34.78 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  35.06 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3341  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  32.45 
 
 		 238 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  26.05 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>