34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6364 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  48.65 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  46.48 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  44.19 
 
 		 266 aa  207  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  46.85 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  42.53 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  43.6 
 
 		 266 aa  174  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  40.07 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  41.04 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  38.37 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  41.04 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  41.04 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  39.37 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  39.37 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  39.37 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  38.8 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  37.05 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  39.15 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  41.15 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  38.85 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  38.75 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  36.8 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  39.38 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  37.07 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  38.77 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  36.07 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  37.12 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  33.2 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  39.29 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  31.45 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  28.68 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  26.82 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  37.93 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  28.48 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>