39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4430 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  100 
 
 		 264 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  62.79 
 
 		 258 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  62.79 
 
 		 258 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  62.79 
 
 		 258 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  58.24 
 
 		 271 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  60.71 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  59.85 
 
 		 269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  62 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  58.33 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  57.75 
 
 		 260 aa  265  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  54.31 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  54.51 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  54.31 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  54.31 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  55.98 
 
 		 332 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  55.68 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  55.68 
 
 		 268 aa  250  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  57.74 
 
 		 269 aa  248  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  50 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  57.59 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  55.29 
 
 		 266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  50.78 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  49.43 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  50.93 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  50 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  44.53 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  49.22 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  42.53 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  43.09 
 
 		 264 aa  185  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  39.68 
 
 		 269 aa  151  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  36.55 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  34.54 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  34.39 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  30.47 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  29.86 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  30.57 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  25.52 
 
 		 238 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  30 
 
 		 209 aa  42.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>