42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2399 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  415  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  40.87 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  36.79 
 
 		 230 aa  117  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  37.13 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  35.75 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  36.98 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  37.88 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  36.5 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  34.92 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  33.02 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  34.88 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  37.37 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  37.16 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  36.08 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  37.08 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  36.08 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  36.08 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  32.85 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  36.27 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  35.64 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  35 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  34.62 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  35.33 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  33.5 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  32.73 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  34.98 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  34.5 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  34.5 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  34 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  35 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  30.2 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  35.58 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  34.1 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  31.25 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  32.42 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  30.57 
 
 		 264 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3508  hypothetical protein  36.25 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3218  hypothetical protein  50 
 
 		 258 aa  42  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000118719  hitchhiker  0.000448278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  54.29 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>