48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0520 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  57.3 
 
 		 202 aa  218  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  46.43 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  39.33 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  38.34 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  38.34 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  38.34 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  37.22 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  39.25 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  36.9 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  36.02 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  36.17 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  35.48 
 
 		 219 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  37.77 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  36.56 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  38.33 
 
 		 216 aa  84.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  30.69 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  35.91 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  36.61 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  34.07 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  33.7 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  33.7 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  34.46 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  32.26 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  33.15 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  34.57 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  34.95 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  33.88 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  35.11 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  34.57 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  29.81 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  33.51 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  30.25 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  30.17 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  26.88 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  25.32 
 
 		 306 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  29.38 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  27.52 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  27.52 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  28.12 
 
 		 284 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  27.52 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  43.24 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  27.91 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  28.66 
 
 		 258 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  28.66 
 
 		 258 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  28.66 
 
 		 258 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  34.12 
 
 		 173 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>