58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3206 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  47.4 
 
 		 196 aa  160  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  47.4 
 
 		 196 aa  160  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  47.4 
 
 		 196 aa  160  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  45.96 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  43.01 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  39.68 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  39.41 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  40.64 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  35.53 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  38.66 
 
 		 211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  36.9 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  37.11 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  37 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  35.18 
 
 		 229 aa  97.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  34.92 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  37.76 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  37.22 
 
 		 224 aa  94.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  37.7 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  38.71 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  31.25 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  38.71 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  30.26 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  38.71 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  35.05 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  34.44 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  32.98 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  32.49 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  32.47 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  31.52 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  32.03 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  31.82 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  36.23 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  25.81 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  30.09 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  25.25 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  32.04 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  30.71 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  29.7 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  27.91 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  27.91 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  30.7 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  31.93 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  26.87 
 
 		 306 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  27.91 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3218  hypothetical protein  51.28 
 
 		 258 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000118719  hitchhiker  0.000448278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3508  hypothetical protein  29.03 
 
 		 237 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3655  hypothetical protein  26.83 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0168589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0057  hypothetical protein  28.33 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  27.04 
 
 		 192 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  30.63 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  29.83 
 
 		 194 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0410  hypothetical protein  51.52 
 
 		 277 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  27.27 
 
 		 267 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  29.01 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  61.76 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>