17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3446 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  61.74 
 
 
238 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3508  hypothetical protein  63.91 
 
 
237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202242  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0057  hypothetical protein  40.48 
 
 
228 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  25.81 
 
 
200 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  36.62 
 
 
215 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  36.62 
 
 
215 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  36.62 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4225  hypothetical protein  39.29 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  29.67 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  44.68 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3849  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  31.31 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  34.85 
 
 
213 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  47.22 
 
 
216 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  40.91 
 
 
198 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>