49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2103 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  59.43 
 
 		 230 aa  251  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  47.83 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  43.81 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  39.68 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  40.87 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  42.35 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  42.71 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  38.12 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  39.5 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  41.01 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  41.87 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  39.13 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  40.76 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  37.13 
 
 		 229 aa  104  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  38.31 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  39.3 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  37.56 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  39.3 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  36.54 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  36.98 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  35.27 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  34.98 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  39.59 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  37.44 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  34.15 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  36.31 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  31.37 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  35.1 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  37.25 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  34.04 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  40.82 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  32.81 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  32.89 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  27.59 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  30.47 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  31.19 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  29.86 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  29.01 
 
 		 306 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  32.39 
 
 		 260 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  29.1 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  31.43 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1122  hypothetical protein  31.65 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  28.32 
 
 		 264 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  47.22 
 
 		 234 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  31.55 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>