35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4990 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  52.91 
 
 		 211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  53.73 
 
 		 215 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  48.36 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  52.94 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  53.75 
 
 		 173 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  38.57 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  43.78 
 
 		 208 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  39.23 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  39.42 
 
 		 209 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  36.95 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  38.71 
 
 		 201 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  37.13 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  36.59 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  36.96 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  36.96 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  36.96 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  35.18 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  38.12 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  35.23 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  33.17 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  35.64 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  35.98 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  34.29 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  32.14 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  37.44 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  31.53 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  34.55 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  36.61 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  32.18 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  32.18 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  32.18 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  31.84 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  30.41 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  24.64 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>