35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2520 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  338  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  61.04 
 
 		 215 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  57.14 
 
 		 211 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  53.75 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  45.12 
 
 		 208 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  43.12 
 
 		 215 aa  98.6  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  41.22 
 
 		 209 aa  97.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  39.35 
 
 		 217 aa  97.1  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  38.36 
 
 		 220 aa  88.2  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  38.97 
 
 		 213 aa  88.2  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  48.98 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  45.24 
 
 		 201 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  37.82 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  49.46 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  38.55 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  34.81 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  40.6 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  36.23 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  42.57 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  38.19 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  38.3 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  50.5 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  51.04 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  51.04 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  40.82 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  41.13 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  31.63 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  33.08 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  33.08 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  33.08 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  39.39 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  36.63 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  29.17 
 
 		 264 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  33.72 
 
 		 198 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>