52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1367 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  54.55 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  51.9 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  51.9 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  51.43 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  39.73 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  36.27 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  40 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  42.17 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  38.86 
 
 		 203 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  34.26 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  39.13 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  33.02 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  35.68 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  37.27 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  31.58 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  36.95 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  34.39 
 
 		 217 aa  95.9  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  37.22 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  34.98 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  33.17 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  36.27 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  37.02 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  37.02 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  37.02 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  36.61 
 
 		 192 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  32.54 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  34.16 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  33.16 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  36.56 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  33.86 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  33.16 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  42.57 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  29.76 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  32.37 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  25.96 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  30.66 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  28.12 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  30.35 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  29.44 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3218  hypothetical protein  46.67 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000118719  hitchhiker  0.000448278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  30.73 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  27.49 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1478  hypothetical protein  54.55 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1500  hypothetical protein  54.55 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  28.75 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  27.04 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1122  hypothetical protein  30.53 
 
 		 261 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  28.89 
 
 		 210 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  27.46 
 
 		 220 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>