56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1129 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  457  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  33.01 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  33.33 
 
 
248 aa  95.1  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  34.91 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  34.91 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  34.91 
 
 
205 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  35.45 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  31.58 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  31.44 
 
 
209 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  31.44 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  32.74 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  31.34 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  31.39 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  31.56 
 
 
210 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  32.11 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  31.13 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  32.43 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  31.65 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  31.84 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  31.9 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  32.61 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  29.33 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  30.82 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  30.82 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  30.16 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  30.77 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  29.49 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  29.47 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  27.78 
 
 
213 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  26.52 
 
 
240 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  34.17 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  32.81 
 
 
216 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  25.96 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  27.83 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  29.21 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  32.66 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  25.25 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  32.79 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  44.68 
 
 
198 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  29.91 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  37.21 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  24 
 
 
271 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  25.12 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  24.64 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  23.48 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  25.12 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  25.12 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  25.52 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  26.32 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  26.88 
 
 
260 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  32.74 
 
 
208 aa  41.6  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  43.59 
 
 
219 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  48.78 
 
 
217 aa  41.6  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>