41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3875 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  387  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  387  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  387  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  57.95 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  56.25 
 
 
192 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  47.4 
 
 
200 aa  160  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  48.19 
 
 
218 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  40.21 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  42.86 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  40.98 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  37.77 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  36.96 
 
 
229 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  38.33 
 
 
230 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  37.5 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  36.13 
 
 
211 aa  98.2  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  38.34 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  36.08 
 
 
214 aa  91.3  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  37.31 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  35.12 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  37.02 
 
 
224 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  35.23 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  33.51 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  38.07 
 
 
227 aa  85.9  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  33.16 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  34.95 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  34.5 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  32.6 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  35.26 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  35.83 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  31.91 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  31.91 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  31.91 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  33.08 
 
 
173 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3897  hypothetical protein  44 
 
 
135 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  25.12 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  32.66 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  28.77 
 
 
306 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  28.7 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  31.51 
 
 
185 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  27.54 
 
 
264 aa  41.2  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>