48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1355 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  55.39 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  58.25 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  47.78 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  39.42 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  39.13 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  39.23 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  36.27 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  36.27 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  37.56 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  36.54 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  38.65 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  34.16 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  36.65 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  35.27 
 
 		 216 aa  95.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  32.16 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  38.97 
 
 		 173 aa  88.2  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  33.51 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  33.51 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  30.26 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  33.51 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  30.73 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  33.5 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  30.85 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  30.81 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  36.9 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  30.81 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  30.81 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  30.65 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  33.51 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  31.53 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  31.6 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  30.77 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  30.73 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  34.17 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  34.06 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  29.88 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  29.77 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3849  hypothetical protein  28.03 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  27.8 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3897  hypothetical protein  70.27 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  29.55 
 
 		 267 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  29.08 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  25.53 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  46.88 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3218  hypothetical protein  36.51 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000118719  hitchhiker  0.000448278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  25.85 
 
 		 306 aa  42  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>