39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4506 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  47.83 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  44.97 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  40.64 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  43.46 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  40.98 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  40.98 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  40.98 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  41.08 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  38.46 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  41.53 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  38.38 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  38.19 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  37.31 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  36.84 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  38.42 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  33.5 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  37.7 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  36.65 
 
 		 213 aa  98.2  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  38.54 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  35.98 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  33.95 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  35.86 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  36.68 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  36.68 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  37.56 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  88.6  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  35.48 
 
 		 198 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  38.89 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  35.36 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  38.55 
 
 		 173 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  36.18 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  31.22 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  31.71 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  28.41 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  33.33 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  31.16 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  29.32 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  26.92 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>