38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1595 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  53.57 
 
 		 199 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  51.66 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  48.19 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  48.19 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  48.19 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  45.96 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  47.92 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  43.46 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  42.71 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  38.12 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  37.11 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  35.32 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  37.75 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  35.24 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  35.48 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  35.75 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  34.39 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  37.8 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  34.33 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  35 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  37.63 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  34.25 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  33.17 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  31.22 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  33.84 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  41.67 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  34.92 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  32.06 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  29.13 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  34.55 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  34.55 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  34.55 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  30.11 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  40.62 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  29.8 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0057  hypothetical protein  29.77 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  30.43 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>