39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1697 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  57.3 
 
 		 198 aa  207  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  40.76 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  40.23 
 
 		 197 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  37.37 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  37.7 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  37.7 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  34.74 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  38.04 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  34.9 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  35.36 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  35.23 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  35.26 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  35.26 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  35.26 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  34.55 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  35.11 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  35.12 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  31.89 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  35.78 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  33.16 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  31.98 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  35.78 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  35.78 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  30.77 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  34.72 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  31.84 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  33.14 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  34.97 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  31.66 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  28.04 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  26.88 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  28.05 
 
 		 306 aa  44.7  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  33.02 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  29.65 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  34.87 
 
 		 167 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>